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用户测评丨华大智造DNBSEQ测序技术助力微康益生菌产品高品质质控

​​益生菌作为人体微生态系统的调节者,在抑制有害菌增殖、促进营养物质吸收和新陈代谢、维持身体健康稳态中发挥着重要作用。菌种质量是决定益生菌产品功效的关键因素,只有严格把控菌种质量,才能保障益生菌行业的持续发展。

为此,微康益生菌研发团队基于华大智造DNBSEQ测序平台开发了微康益生菌菌种质量控制解决方案,旨在将先进的测序技术与菌粉产品质控结合起来,解决传统方法益生菌分离筛选的耗时耗力、效率低、无法培养菌种、鉴定难,以及无法进行功能验证等难题。

微康益生菌菌种质控解决方案由华大智造快速灵活的DNBSEQ-G99基因测序仪、自动化样本制备系统MGISP-100RS、全自动核酸提取纯化仪MGISP-NE32RS以及生信分析软件等组成了全流程的工具组合,助力益生菌产品生产工艺的各环节进行质量控制。

优势表现

1.测序准确性高且稳定性高

对于企业在菌种质控环节的使用,检测平台的稳定性和产出数据准确性都非常关键。DNBSEQ测序技术具有滚环复制扩增带来的错误累积低和规则阵列载片带来的信号密度高等原理性优势,大幅提高了测序准确性;同时结合全新一代StandardMPS 2.0测序试剂,DNBSEQ-G99所有读长的测序质量现已提升至Q40。

微康益生菌研发团队累计实测1000+例样本,平均数据量129 M(120~150M),单载片80M reads达标率100 %,平均Q30为94.1%(93.3~97.2%),充分展示了DNBSEQ-G99测序数据质量好、稳定高等优势性能。

注:柱状体底部为样品编号,数据统计量为1000份样品

DNBSEQ-G99是目前全球中小通量测序仪中速度最快的机型之一,其简单灵活、数据质量高的特点,以及卡片式测序载片和一体化试剂盒设计等突破性创新优势,实现了测序效率、质量和交付能力的极致提升。基于DNBSEQ-G99快速高效等优势,目前已在公共卫生致病菌的鉴定和溯源有广泛的应用,未来也将进一步拓展应用到工业微生物的精准鉴定与溯源分析、菌种评价、菌种改造验证等环节。

DNBSEQ-G99测序仪在微康益生菌实验室运行

2.运行速度快、效率高

DNBSEQ-G99为双载片平台,支持单载片测序、双载片同时测序、双载片滚动上机测序,以及混合读长的双载片混动上机测序等多种测序模式。实验人员可根据当批次样本数量灵活选择运行载片数量和测序模式,可支持实验中64个WGS样品/run,当天可出结果,兼顾了测序通量+测序时效性,可满足用户日常生产中的测序要求。

值得一提的是,采用DNBSEQ测序技术的G99测序仪可用于直接鉴定难以检测或难以培养的微生物,为用户提供精准的菌种鉴定结果。

三种检测技术耗时对比

3.数据库菌种覆盖范围广

PFI数据库收录包含细菌、真菌等在内的超过2万多种微生物基因组信息,而且覆盖几乎当前所有益生菌菌种的基因组序列,包括微康益生菌生产中常用的50余种益生菌,例如:乳杆菌属、双歧杆菌属、链球菌属、肠球菌属、乳球菌属、片球菌属、葡萄球菌属、芽孢杆菌属以及明串珠菌属。

注:PFI数据库收录超过2万多种微生物,支持定期更新

华大智造生命科技核心工具助力微康益生菌结合了科研和产业的需求,覆盖益生菌制品纯度和安全质控、菌种鉴定和功能评价、菌种代谢功能挖掘与分析,以及工艺条件探索与优化,为食品、乳制品、保健食品、精准医学、日化用品、农牧业等领域提供高活性益生菌菌粉、发酵食品菌种、微生物产品及应用解决方案。

微康益生菌领先的基础研发、产业化中试、检测中心三大技术平台支撑了益生菌菌株的功能研究和产业化、规模化智造,提供高品质高活性益生菌菌粉、微生物产品及应用解决方案,促进人类健康和环境可持续发展。

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